在卢植投奔王琦，皇甫嵩和董卓奉命调往雍州的同时，右中郎将朱儁来到了兖州，主持兖州境内和黄巾军的战事。
张角所部黄巾军本来被卢植打得节节败退，眼看要完蛋。不料卢植因为拒绝行贿被查办，换上个董卓，张角因此得以喘息。
随后，在豫州战场上被朱儁打败的黄巾军波才、彭脱残部退入了兖州，虽然败军不可言勇，但张角合兵一处，兖州的黄巾军力量客观上得到了加强。
朱儁抵达兖州后，依然拿出豫州战场上那一套，对付张角，逐渐挽回了董卓造成的不利局势，再次占据了上风。但是，毕竟张角把握住喘息时机，兵员又得到了补充，朱儁一时无法彻底得胜，双方进入胶着状态。
和黄巾军作战的总负责人大将军何进得到朱儁的报告后，增派兵力，让典军校尉曹操率军援助兖州。
曹操字孟德，胆量过人，机谋出众，笑齐桓、晋文无匡扶之才，论赵高、王莽少纵横之策，用兵仿佛孙、吴，胸内熟谙韬略。
曹操本来复姓夏侯，他的父亲夏侯嵩过继给先后伺候过四代皇帝，从未犯过错误的大宦官曹腾为养子，因此改姓曹。曹嵩历任司隶校尉、大司农等显职，现任大鸿胪。
曹操少年时，好飞鹰走犬，喜歌舞吹弹，机敏过人，狡猾多端。曹嵩见曹操游荡无度，数次对曹操提出批评，但根本管束不了曹操，气得曹嵩经常鞭打曹操，但也不怎么管用。
曹操虽然不喜欢受约束，但是经常写诗，通过诗文表达自己的远大志向和政治抱负。曹操还认真研习兵法，曾经给《孙子兵法》作注。
世人只看到曹操恣意放荡，不务正业的一面，都觉得这个人实在不可救药。可是，也有识人之人，前太尉桥玄一见曹操，就指而言曰：“天下将乱，非命世之才不能济也。能安之者，其在君乎？”
当时，汝南许劭有识人之明，每月集会，品评天下人物，被许劭点评的人物都身价百倍。桥玄见曹操缺少名望，建议曹操去找许劭，让他点评点评。
曹操找到许劭，请许劭点评。可是，许劭不喜欢曹操，根本不答理他。曹操很生气，拉出佩剑，放在许劭的脖子上，逼着许劭评论。许劭万般无奈，只好道：“子治世之能臣，乱世之奸雄也。”
曹操听了，忍不住大笑，心想：“可笑啊可笑！能臣固我所愿也，奸雄也不错呀。要是适逢治世，我就造福一方；要是不幸赶上乱世，我就称霸一方吧。至于是能臣还是奸雄，哼，我看也无所谓。”
曹操20岁时，担任洛阳北部尉，负责都城中一个区域的治安。初到任，曹操设立五色棒，抓住违反治安条例的，爱谁是谁，先海扁一顿。曹操仗着身居高官的父亲和雄厚的家族后台，甚至连蹇硕的叔父都叫他给打了。
为了抵抗黄巾军侵犯司州，朝廷任命曹操为典军校尉，负责守卫京师。
在何进和西园八校尉的率领下，朝廷终于平定了司州境内的黄巾军。之后，曹操被派往兖州帮助朱儁。
曹操来到兖州后，立刻打破了朱儁和黄巾军的平衡。
朱儁不能彻底消灭兖州黄巾军，是因为黄巾军的人数和游击战术。曹操带来的1万精锐部队，以骑兵为主，原来朱儁追赶不上的黄巾军游击队，往往被曹操率领的骑兵干掉。
朱儁又把属下骑兵又调拨给曹操1万人，把曹操的部队全部换成了骑兵。朱儁和曹操联合作战，曹操发挥骑兵的机动性，负责追逐黄巾军。朱儁则率领大部队，尽量配合曹操。两军彼此呼应，重创兖州黄巾。
四月中旬，在曹操所部骑兵的追逼下，黄巾军地公将军张宝被赶进了朱儁设在济阴郡成武县一带的包围圈。虽经死战，张宝还是被朱儁所部杀死。
接着，朱儁在山阳郡金乡县一带大破黄巾军大方首领赵弘部，击毙赵弘，叙功被加封为上虞侯。
赵弘死后，韩忠收拢赵弘残部，集结了9万黄巾军，猛攻朱儁。朱儁刚刚杀败赵弘，士卒不及休整，韩忠大军冲来，一时抵敌不住，遂暂时退避。韩忠缺少智谋，不但没有乘胜追击，反倒心生骄傲，防范渐松。
朱儁没有退出多远，见黄巾军没有追来，就停止退却，派遣斥候打探。探得黄巾军防御松懈以后，朱儁紧急联络曹操，两面夹击。
朱儁亲自率军冲杀，士卒因此士气高涨，加上曹操以骑兵冲杀，韩忠大败，黄巾军被杀者数以万计。
韩忠随即向朱儁乞降，朱儁不接受。曹操建议朱儁收降黄巾军降卒，朱儁仍然不允。曹操没有办法，私自收降了超过2万人的黄巾军。
朝廷接到朱儁的捷报，封朱儁为车骑将军，加封为槐里侯。可是，朱儁不够意思，只提自己的功劳，根本不提曹操。
曹操自此彻底认清了灵帝君臣实在不值得为伍，渐生异心，开始寻找一切机会，扩充真正属于自己的力量，第一步就是尽量收降黄巾军士卒。
五月，曹操提兵鲁郡，在鲁郡北端的汶阳县击破大方首领张宽所部黄巾军，杀敌约5000人，却接受了降卒近3万人，并缴获了大量马匹辎重。
六月，曹操和朱儁在任城郡樊县消灭了从豫州败退到兖州的黄巾军彭脱部。朱儁照例杀杀杀，曹操只管收收收。
至此，兖州黄巾军只剩下张角、张梁和波才率领的大约5万人了。张角被曹操和朱儁步步紧逼，被迫回到了泰山郡黄巾军起家的地方，在泰山一带勉力躲避官军的追杀。
朱儁老奸巨猾，知道张角倚仗山势，和官兵捉迷藏，实在难以追及，干脆以逸待劳，找个交通便利的地方扎下大营，多派斥候，追寻张角的下落。
朱儁掌握了张角的动向，根据张角的行动习惯，逐渐收紧了包围圈，终于把黄巾军包围在泰山西麓。
朱儁和曹操一致认为，黄巾军虽然已经处于绝境，但是一旦临死反扑，己方难免损失惨重。因此，两人决定用火攻为张角送终。
入夜后，官兵纵火焚烧了黄巾军的兵营。黄巾军在睡梦中惊醒，四散奔逃，互相踩踏，狼狈不堪。天明后，朱儁和曹操率兵掩杀而来。一场血战，张梁和波才拼命力保张角逃命，断后死战，先后战死。
黄巾军士卒仗着山区地形复杂，一部分侥幸逃到山里。没逃掉的黄巾军中，运气好的遇到曹操的部队，有机会免于一死，投降了曹操。倒霉的遇到朱儁的人马，基本上只剩下死路一条。
张角凄凄凉凉，只剩下1000多人，勉强逃到了冀州边境。
王琦交给张角的信，张角始终珍藏着。但他始终不相信自己会陷入绝境，一直没有看信。直到黄巾军被官兵逼到了泰山脚下，张角才把信带到身上，这时他不是不想看，而是没有勇气看信了。
望着近在咫尺的冀州，走投无路的张角终于用颤抖的手撕开了信封，信上写到：“大贤良师：讨伐你的，先后有卢植、皇甫嵩、朱儁、曹操、董卓等人，还可能有我冀州兵马。你看到此信时，必定已入绝境。你三兄弟虽自称天公、地公、人公，但不知天时，不识地利，不得人和，故有此败。你可持此信，尽携黄巾余部，降我冀州，可保尔等不死，且不交与朝廷。”
张角如遭五雷轰顶，呆若木鸡。
王琦给他这封信时，张角还在冀州巨鹿郡隐居。“大贤良师”、“天公将军”、“地公将军”、“人公将军”这些称呼，都是张角三兄弟后来的称呼。张角在冀州时，这些称呼连设想都不存在，王琦居然先张角一步，清清楚楚地写在了纸上！此时的张角，要想不相信王琦知晓天意都难。
张角自胸怀大志到拥兵百万之众，再沦落到如此地步，人生中的大起大落一一体验，自己的兄弟、部属、朋友都相继永远离去了，心灰意冷，恨不得大地突然裂开，把自己吞噬进去。
不是王琦这封“预见未来”的书信，张角肯定自决于冀州边境，不过，看了这封信后，张角决定去见王琦。他倒不是怕死，而是要亲眼看看王琦最终能否成就霸业，还有就是想借助王琦的力量报仇雪恨。
于是，张角沿着当初被王琦放逐的老路，取道平原郡，回到了久别的冀州。
王琦早在去年秋天就密令给冀州边界各郡，一旦张角本人没带多少兵力进入冀州，要求和自己见面，各郡太守要负责尽快把张角秘密送到邺城。
接到密令的太守没人相信张角会来，可是张角就是来了！虽然震惊，平原郡太守还是忠实执行了主公的命令。
刘备实在是点背，他好不容易巴解上卢植，虽然立了功，但卢植却被贬了……曹操却实在点正，恰到好处地赶到兖州，捞了个脑满肠肥，收降了7万多名黄巾降卒，加上他老实不客气地查收了朱儁派给他的骑兵，加上原来的队伍，曹操的家底已经有9万之众。
曹操把这些士卒打发回老家，带着张宝、张梁、波才等的首级回到京城。
在此之前，董卓、张温已经回到了京城，在庆祝雍州保卫战的胜利。
灵帝自从张角起事以来，已经郁闷了好久了，现在，高兴事接踵而至，欢乐充满了他的胸臆。除了大赏功臣以外，灵帝还能做什么呢？
作者按：司隶校尉为汉武帝始置，负责管理京城治安，查捕罪犯。刘备在蜀称帝后，张飞曾任司隶校尉。
大司农为九卿之一，掌管租税、钱谷、盐铁和国家财政收支。
大鸿胪为九卿之一，掌管皇家接待宾客之事，地位在大司农之上。
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