“1、海军中袁世凯、刘冠雄余党要清除干净，在政治上必须取得一致；
2、凡在行营外违反禁令（包括吸毒、赌博、嫖娼、私自在外居住等）给社会造成不良印象的海军官兵，军官一律撤职查办，士兵一律遣散；
3、在行营内部违反禁令进行赌博的，视情节轻重，分别给予训诫、警告、罚薪、撤职查办（遣散）等处分，凡累犯者，一律撤职查办（遣散）；
4、在行营内部违反禁令吸食鸦片的，限令一个月戒绝，戒绝期间一律调离原岗位，军官撤销职务保留军衔，一个月后视身体恢复情况重新安排工作，如不能戒绝或戒绝后复吸的，一律撤职查办；
、有其他严重违法行为，如结党营私、贪污舞弊等，责令严查，按查处结果予以处分；
6、凡官兵请假，无正当理由逾期不归者，超假半月以内，予以训诫、警告或罚薪处理；超假半月以上，一律遣散，取消海军军籍；
7、保民等7舰除籍后所有官兵编列候补，根据其余舰艇之空额按照能力、军衔、职务统一替补；
8、在以上基础上，重新安排各舰军官，进行改组，凡属逾期未归者，一律不予安排工作。”
萨镇冰、程壁光请罪：“海军目前情况，我等有不可推卸之责任，恳请大总统予以处分。”
“海军的现状，是袁世凯、刘冠雄等人一手造成的，和你们两位没有多大联系，但既然目前海军整肃，这失察一事恐怕也有若干关系，我想你们两个就接受一次训诫，也当是一次教训。”
“谢总统宽容。”
“汤芗铭虽然不在行营。但对海军近况亦有不小责任。同样给予训诫。”秦时竹想了想。“李鼎新直接负责海军基地管理。责任最大。情节也最严重。刚才前去时已是深夜。居然连酒都未醒。可见放肆到何等地步。此人不可再用。”
萨镇冰、程壁光等皆称善。
“那再请百里兄将海军改组意见谈一谈。”
“海军改组。一方面牵涉到旧有机构地撤销。另一方面又需要建立、健全新机构。海军部撤销后。由国防次长统管海军。设立海军司令部。同样下设海军四总部。原左右舰队一体撤销。”蒋方震随即拿出了他地高层名单：
海军总司令：萨镇冰上将（国防次长兼。统管海军）
海防总监：程壁光中将（副总参谋长兼。协同统管海军）
常务副司令：汤芗铭中将（原海军次长。分管基地、舰队，原舰队总司令李鼎新撤职查办）
副司令：蓝建枢少将（原左舰队司令，协助分管基地、舰队。原副司令蔡廷干撤职查办）
海军参谋长：徐振鹏少将（原右舰队司令）副参谋长：毛仲芳上校（原海军部参谋）
海军政治部主任：李景曦少将（原驻英学生监督）副主任：谢葆璋上校（原二等参事）
海军装备部主任：李和少将（原驻英舰艇制造监督）副主任：吴德章上校（原海军部造船总监）
海军后勤部主任：黄裳治少将（原海军部一等参谋）副主任：谢刚哲上校（留日海军第一期）
经过这一番简化，原海军部人员臃肿、机构过大的情况得到了改变----试想当时陆军部和海军部官员人数几乎一样多，陆军多少人？海军才多少人多少舰？明显不合理）。
“四总部设立后，海军基地由常务副司令汤芗铭直管，海军参谋部主要负责舰队日常训练、演习、作战等事宜；海军军纪、教育、研究所由海军政治部分管；海军各制造厂由海军装备部分管；后勤独立，由海军后勤部分管，逐步废除舰长人事任免权和财政统辖权。”按照这一设想，重新任免如下：
北疆船舶高等学院在吸收烟台海军学堂后改称海军学院（原烟台海军学堂监督郑汝成撤职查办）
院长：叶在馥代将（原船舶高专校长）
副院长：高平寒上校（原船舶高专副校长）
教育总监：谢葆璋上校（兼）
教育少监：江中清中校（原烟台海校教务长，实际主持工作）
技术总监：王伯屏中校（著名轮机专家。留英）
技术少监：顾燕逸少校（王伯屏师弟，著名造船专家，留英）
训练总监：叶幼峰中校
训练少监：朱正霖少校（原烟台海校斋务长）
这个方案都是萨镇冰、程壁光和蒋方震商量过又商量再经过秦时竹的点头，现在提交出来，众人都表示没有异议。
“方才我找了沈鸿烈和凌霄谈话，都不约而同地谈到了目前海军中存在问题，尤其是派系之分，我在考虑，对舰队进行改组时。需要照顾这个情形。”秦时竹笑着对萨镇冰说，“这倒不是说闽系的人物不好，辽系的人物都好，你们看，今天陈绍宽、程耀垣、刘永浩、孟幕超等人的表现就不错，特别是陈绍宽，表现极为突出，不仅考试是满分，问题回答得不错。而且还能发动全舰官兵一起进修。堪称难得，这样地人才不重用我们还等什么？如果再按照刘冠雄论资排辈、讲究资历那一套。恐怕我们永远都得跟在别人后面亦步亦趋……考虑到这一、二年我们新接收和即将接收新舰艇，我拟成立一个练习分舰队，由新锐之将士担纲，以免沾染上那些暮气。”
一番话听得众人都是点头，但秦时竹的提拔方案却将几人吓了一跳。
“陈绍宽、程耀垣由少校擢为中校，分任应瑞、肇和两新式巡洋舰副舰长、代舰长，以一年为期进行考察，如果真胜任其职，一年后正式任舰长。”
“总统，这样一来。陈、程二人等于一次连升两级，是不是太过于飞速？”程壁光说了他的疑虑，“绍宽还好，耀垣嘛……”
“哈哈，我的程副总长，海军搞裙带之风是万万不可。不过如果你为了避嫌，凡是沾亲带故的优秀都不敢重用，如何能为国惜才--内举不避亲嘛！再者，耀垣前清时节已是少校军衔，前次晋升都让你硬生生给阻拦了，此次再不晋升，我对你可有意见了。”
众人大笑，程壁光也笑了。
“这样的破格提拔，不光光是为了表彰这上面几人。同时也是在给全体海军将士发信号。有些年轻军官，未必甘于沉沦，只是因为风气不好。上梁不正下梁歪，故而也沾染了一些不良习气，如果我们适时竖立几个典型，便可以实际例子来告诫他们奋发向上。从派系平衡考虑，我刚才着重提拔地都是闽系人物，在海军内部看来必然是公正之举，显得我对派系没有偏见只有唯才是举的方针，也有利于下一步改革。”
“总统从来都是唯才是举，没有门户之见。我和萨次长极为服膺，相信下面人也会体谅总统一片苦心。”
经过一番商议，练习舰队的名单新鲜出炉：
练习舰队辖通济、应瑞、肇和、北训四舰，将来再增飞鸿、龙湍两舰。
练习舰队司令：葛宝炎上校
舰队副司令：刘永浩中校（留英）
通济舰长：葛宝炎（兼）
副舰长：彭瀛少校
练习舰队参谋长：孟幕超中校（留英）
练习舰队参谋：刘华式、周光祖、李右文、萧宝所（皆是留日第三期，上尉军衔）
应瑞副舰长（代舰长）：陈绍宽中校
肇和副舰长（代舰长）：程耀垣中校
北训舰长：郑礼庆中校（留日第二期）
副舰长：姚葵常少校（留日第二期）
飞鸿接收专员：叶芳哲少校（留美）
龙湍接收专员：陈石英少校（留美）
夜色已经深沉，但是花车的灯光却一直没有熄灭，直到凌晨三时许，才在蒋方震、萨镇冰和程壁光三人所拟定名单地基础上完成了改组方案：
舰队下设主力支队、游击支队、运输支队三个部分
主力支队下辖海圻、海容、海筹等主力舰艇
主力支队司令：汤芗铭（兼）
副司令：蓝建枢（兼）
海圻舰长：汤廷光上校（原代舰长）
副舰长：郑祖怡中校（原代副舰长）
海容舰长：杜锡上校
副舰长：林建章中校（原南琛舰长，原舰退役）
海筹舰长：林颂庄上校
副舰长：何心川中校（原镜清舰长。原舰退役）
海琛舰长：林永谟上校
副舰长：甘联敖中校（原保民舰长，原舰退役）
飞鹰舰长：曾兆麟中校（原林颂庄兼）
副舰长：赵士淦少校（原南琛副舰长）
建威舰长：郑纶少校（原舰长程耀垣）
建安舰长：林国赓少校
同安舰长：吴光宗少校
豫章舰长：吴志馨少校
豫康舰长：郑硕简少校
联鲸舰长：李毓麟少校（留日二期，原舰长陈绍宽）
楚观舰长：吴振南中校
楚谦舰长：王光熊少校
楚豫舰长：方佑生少校
楚泰舰长：马陨玉中校
楚同舰长：何广成中校
楚有舰长：魏子浩少校
江元舰长：郁邦彦少校（原舰长温树德撤职查办）
江亨舰长：邓家骅少校
江贞舰长：周兆瑞少校
江利舰长：朱天森少校永翔舰长：薛启华少校
永丰舰长：林霆亮少校（原登瀛洲舰长，原舰退役）
甘泉舰长：杜逢时少校
舞风舰长：王传炯少校
游击舰队辖春、夏、北巡、北视四舰和辽兴、辽平、辽远、辽静四艘鱼雷艇，基本是原先辽系人马，
游击支队司令：沈鸿烈上校（与凌霄各晋升一级）
副司令：凌霄中校（留日第二期）
春号舰长：沈鸿烈（兼）
副舰长：杨宣诚少校（留日第二期）
夏号舰长：凌霄（兼）
副舰长：刘田甫少校（留日第二期）
北巡舰长：方念祖少校（留日第二期）
北视舰长：宋式善少校（留日第二期）
游击支队参谋：朱伟、杨启祥（主要负责政治宣传工作）
运输支队辖北运、福安两艘运输舰
运输支队司令：王时泽中校（留日第二期）
北运舰长：王时泽（兼）
副舰长：杨征祥少校（留日第二期）
福安舰长：李国堂中校
副舰长：张楚材少校（留日第三期）
新调任少校一批，充实各巡洋舰轮机长、航海长职务；新晋升、调任上尉一批，充任各炮舰副舰长和各驱逐舰轮机长职务；晋升、调任中尉一批，充任各炮舰轮机长、各巡洋舰（驱逐舰）枪炮长等职务……
另新任命上尉和中尉一批。为各鱼雷艇正副舰长。陈策担任列字鱼雷艇上尉舰长。
天亮了，整个海军行营都在惴惴不安地等待着命运的宣判。那些犯有过错、特别是当场被宪兵逮住的更是提心吊胆。让葛洪义、蒋方震颇为担心的海军异动倒是没有发生，一方面宪兵和特警发挥了极大的威慑作用，纵然有人图谋不轨，也难以动手；另一方面，海军处于休整状态，军火库被他人牢牢掌握。有心造反也没有武器，即使再疯狂地人，也不会拿着鸡蛋去碰石头，更何况鸡蛋本身还有不同意见呢。
宣判地结果既出人意料，又在大家的预料之中，海军行营地礼堂里，当着全海军少尉以上军官的面，蒋方震代表大本营宣布了海军改组方案--有人欢喜有人忧。
陈绍宽、程耀垣等人昨天回去后就在讨论会有什么结果，叽叽喳喳地兴奋了大半夜。突然听得被任命为应瑞、肇和两舰地主官，高兴地差点跳起来，而李鼎新回去后担心了一夜。此刻听到消息，犹如一桶冰水从头浇到脚，他聊以自慰地想：不幸中的万幸是这个处理只是撤职查办，官虽然做不成了，脑袋毕竟还在。
以此为标志，海军进入了大整顿时期，前前后后总共有200多名军官被免职、1300多名不合格的水兵被剔除了海军--中国海军，荡涤了他的污秽，补充了新鲜血液……
后世出版的有关海军史著作。一概将此次整顿称之为“民国海军第一次整风”，认为“此次整肃，充分体现和贯彻了秦时竹总统有关海军地建军思想和方针，这一次以军纪为核心地整风运动，基本扭转了民初海军所存在地不良习气，对其日后地发展打下了坚实的基础，更为难能可贵的是，此次整风虽然力度极大，但在事后基本没有造成多大的反弹。所有的舆论也是一边倒的支持……虽然这次整风依旧保留了大量的保守力量和派系隔阂，算不上彻底，但正是在这次整风中，后来在中华民国海军史中大放光彩地几位高级将领如沈鸿烈、凌霄、陈绍宽、程耀垣、陈策等，开始崭露头角……因此，无论从哪个角度分析，整风都是成功地。”
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