混沌世界，道祖鸿钧道人令盘古开天劈地，立地水风火，盘古力竭而死，元神一分为三，为太上老君、元始天尊、通天教主；天地初开后，盘古的十二份精血吸收了天地浊气后，化成十二尊大神，这十二大神乃一脉而生，喜外修筋骨，掌天地灵气，法力近似无边，号称十二祖巫，自此巫门形成。
十二祖巫晋升天神后，以强大巫术引导人间巫士飞升天界，大神后羿和东皇太一之子掌管太阳升落的十只金乌发生冲突，一怒之下，射杀了九只金乌，这才引发了大战矛盾激化，东皇太一以此为借发动妖巫大战，巫兴妖衰，凡间大夏建国铸九鼎，立巫为国教，强盛一时，后商灭夏道教兴起，人间巫教陨落，但巫并没有绝迹，被驱逐出中原封印在某一个诡异角落，等待后世巫星出世，重塑巫教辉煌！
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